『踊る大捜査線』シリーズで柳葉敏郎演じる人気キャラクター・室井慎次を主人公に描く、映画二部作の後編。室井の家の傍で発見された死体は、室井が指揮を執ったレインボーブリッジ事件の犯人グループの一人だった。室井は、かつての同僚であり今は秋田県警本部長になっていた新城に頼まれ、警視庁捜査一課の若手刑事・桜とともに捜査に協力する。そんな中、服役を経て出所したリクの父親が訪ねてくる。