１９３６年。手にした者に無敵の力が宿るという旧約聖書の伝説のアーク（聖櫃）を手中に収めようとするヒトラー。世界征服を企むヒトラーの野望を打ち砕くため、アメリカ政府から依頼を受けた若き考古学者インディ・ジョーンズは、砂漠に眠るといわれるアークを求め、かつての恋人マリオンとともに冒険へと旅立つ。行く先々で恐るべき罠や蛇の大群に悩まされながらも、南米大陸からエジプトへと地球を股にかけた冒険は続く。